Linux下安装netCDF4过程记录

1. HDF5安装
2. netCDF-4 C library 安装
3. 安装netCDF4 python包

netCDF4官方指南

HDF5安装

HDF5网站
INSTALL FILE
1、在HDF5网站上下载hdf5-1.10.3.tar.gz源码
2、在Ubuntu16.04上安装HDF5
使用以下安装脚本

tar zxf hdf5-1.10.3.tar.gz
cd hdf5-1.10.3
./configure --prefix=/usr/local/hdf5  --enable-hl --enable-shared
make
make check                # run test suite.
make install
make check-install        # verify installation.

如果遇到安装失败，可能需要sudo make

netCDF-4 C library 安装

netCDF-4 C github repo
Build Instruction
1、下载netcdf-c-4.6.1.tar.gz
2、安装
使用以下脚本

# Build and install netCDF-4
tar zxf netcdf-c-4.6.1.tar.gz
cd netcdf-c-4.6.1
NCDIR=/usr/local
H5DIR=/usr/local/hdf5
CPPFLAGS=-I${H5DIR}/include LDFLAGS=-L${H5DIR}/lib ./configure --prefix=${NCDIR} --enable-netcdf-4 --enable-shared
sudo make check
sudo make install  # or sudo make install

3、遇到问题：使用git clone下来的源码，没有configure，无法build。

安装netCDF4 python包

USE_SETUPCFG=0 HDF5_INCDIR=/usr/include/hdf5/serial HDF5_LIBDIR=/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial pip3 install netCDF4